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有孔虫界 化石时期：新元古代 - 現代
嗜溫轉輪蟲 Ammonia tepida
科学分类
总域：	新壁總域 Neomura
域：	真核域 Eukaryota
（未分级）：	雙鞭毛生物 Bikonta
（未分级）：	多貌生物 Diaphoretickes
演化支：	SAR超类群 SAR
界：	有孔虫界 Rhizaria Cavalier-Smith，2002
門
絲足蟲類 Cercozoa 有孔蟲類 Retaria 有孔蟲門 Foraminifera 放射蟲門 Radiolaria

有孔蟲界（学名：Rhizaria）為原生生物的一條主線。它們的形態差別很大，但主要部分均為變形蟲狀（amoeboid）並有絲狀、網狀或小管型支撐的假足。它們部分會製造可能有複雜結構的外殼或骨架，而這些外殼或骨架成為絕大部分的原生動物化石。它們差不多全部都擁有管狀脊的線粒體。有孔蟲界分為三類：

• 
  絲足蟲類 - 各種各樣的阿米巴及鞭毛蟲（flagellates），通常擁有絲狀的假足，在土壤十分常見。


• 
  有孔蟲門 - 變形蟲狀、擁有網狀假足，通常為海洋的底棲生物（benthos）。


• 
  放射蟲門 - 變形蟲狀、擁有軸足（axopods），通常為海洋的浮游生物（plankton）

其他類別有可能被歸入絲足蟲類，但部分分支則較為接近有孔蟲門。她們為Phytomyxea（英语：Phytomyxea）及Ascetosporea（英语：Ascetosporea），分別為植物及動物的寄生生物，與及特別的阿米巴Gromia（英语：Gromia）。有孔蟲界的不同組別主要因為基因上的相似性而被認為是近親。她們亦被認為是絲足蟲類的伸延。有孔蟲界的名稱Rhizaria由Cavalier-Smith在2002年提出，他亦提出了Apusozoa（英语：Apusozoa）及centrohelid的名稱。

進化關係

現代真核生物分類

與其他界別的關係

有孔蟲界為雙鞭毛生物分支的一部分，亦包含泛植物（Archaeplastida）、囊泡藻（Chromalveolata）、古虫界（Excavata）與及其他較小、未分類的組別例如无根虫门（英语：Apusozoa）（Apusozoa）及Centrohelid。和其他雙鞭毛生物相同，她們均源自擁有兩個鞭毛的真核異養生物（heterotrophic）。亦有想法認為有孔蟲界與古虫界有與其他組別相比，在分支稱為（Cabozoa）中有較深的關係。

歷史上其分類的演化

歷史上很多有孔蟲界的生物因為其機動性及異養性而被認為是動物。但自從五界系統（Five-kingdom system）替代動植物生物的二分法（dichotomy）成為主流後，有孔蟲界被當為原生生物界。接著，卡尔·乌斯（Carl Woese）刊出其三域系統。因為無核生物界（或稱為原核界，Monera）是并系群，分類學者把注意力轉移在真核生物領域及原生生物（Protista）的固有并系群上。經過大量討論後，現在討論仍然持續，有孔蟲界被歸類為有效的單系群分類。

參考資料

• 
  Cavalier-Smith, Thomas. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2002, 52 (2): 297–354 [2007-06-08]. ISSN 1466-5026. 
  


• 
  Nikolaev, Sergey I.; Cédric Berney, José F. Fahrni, Ignacio Bolivar, Stephane Polet, Alexander P. Mylnikov, Vladimir V. Aleshin, Nikolai B. Petrov, and Jan Pawlowski. The twilight of the Heliozoa and rise of the Rhizaria, an emerging supergroup of amoeboid eukaryotes. 美國國家科學院院刊. 2004, 101 (21): 8066–8071 [2007-06-08]. ISSN 0027-8424.  引文使用过时参数coauthors (帮助)
  

外部連結

• Molecular Phylogeny of Amoeboid Protists - Tree of Rhizaria